圣索菲亚教堂建成在几座教堂的旧址上，其中最早的可以追溯到4世纪。在此期间，索非亚被称为古罗马的塞尔迪卡城。
几个世纪以来，一系列后续的教堂在原来的4世纪教堂的遗址上建造，只是被入侵的军队摧毁了。在每一波破坏之后，一座新的教堂在原来的地方竖立起来。目前存在的教堂被认为是在这个地方的宗教建筑的第五次迭代。
最近的圣索非亚教堂建于6世纪中叶的某个时候保加利亚在拜占庭皇帝查士丁尼一世的统治下
16世纪，在奥斯曼帝国的统治下，这座教堂被改建为清真寺，为穆斯林服务。原来的教堂在大约三个世纪的时间里一直是清真寺。这座清真寺在19世纪被废弃俄罗斯它是保加利亚解放时的教堂，后来被重建为教堂。
挖掘周围地区的考古学家发现，这座教堂位于一座古代墓地的遗迹之上。今天，许多毁坏的坟墓都被小心地发掘出来，并向公众开放。这项考古工作有助于揭示这座前罗马城市的规模。
教堂下面有几层，反映了历史上不同的时代，每层都有几个信息展示板。地下墓室的特色是以前教堂地板上的马赛克，还有大约50座坟墓，其中一些坟墓里有壁画和其他古代文物的痕迹。每一层的部分都安装了现代楼梯和透明地板，以显示和保护下面的表面。
出发前要知道
墓地的入口在圣索菲亚教堂内。当你走进去，头部经过小商店区，左转进入楼梯。
有几个楼梯，地板不平整的区域，整个建筑群的照明都很昏暗。
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